Bioinformatics with Biopython

• Python doświadczenie w programowaniu

Publiczność

• Bioinformatycy

Biopython jest biblioteką open source dla biologii obliczeniowej i bioinformatyki. Biopython zapewnia użytkownikom możliwość automatyzacji badań medycznych w dziedzinie bioinformatyki.

Szkolenie na żywo prowadzone przez instruktora (na miejscu lub zdalnie) jest przeznaczone dla biologów, którzy chcą korzystać z Biopython.

Po zakończeniu tego szkolenia uczestnicy będą w stanie

• Integrować koncepcje biologiczne z technologiami informatycznymi w celu rozwiązywania problemów badawczych.
• Wydobywać informacje z dużych zbiorów danych pochodzenia biologicznego.
• Tworzyć algorytmy dla podstawowych zadań badawczych.

Format kursu

• Interaktywny wykład i dyskusja.
• Wiele ćwiczeń i praktyki.
• Praktyczne wdrożenie w środowisku laboratoryjnym na żywo.

Opcje dostosowywania kursu

• Aby poprosić o spersonalizowane szkolenie dla tego kursu, skontaktuj się z nami w celu ustalenia szczegółów.

Wprowadzenie

Przegląd Biopython

• Czym jest Biopython?
• Funkcje Biopython

Przygotowanie środowiska programistycznego

• Instalowanie i konfigurowanie języka Biopython

Wprowadzenie do Bioinformatyki

• Historia Bioinformatyki
• Podstawy Bioinformatyki

Bioinformatyka Database

• Databasestruktury danych
• Praca z Biologicznymi bazami danych i plikami

Sekwencjonowanie Biologiczne

• Manipulowanie danymi
• Korzystanie z macierzy
• Tworzenie algorytmów

Filogenetyka i genomika

• Tworzenie drzew przewodnich
• Tworzenie drzew filogenetycznych
• Praca z genomami
• Porównywanie genomów

Podsumowanie i wnioski