Fiji: Image Processing for Biotechnology and Toxicology

• 对生物成像概念的基本理解
• 熟悉显微镜和组织学技术
• 基本的计算机操作能力

受众

• 生物技术和环境毒理学领域的研究人员
• 从事组织学和细胞成像的实验室技术人员
• 对定量图像分析感兴趣的科学家

Fiji 是一个基于 ImageJ 的开源图像处理包，专为科学图像分析设计，尤其适用于生物学研究。

本次由讲师主导的培训（线上或线下）面向初学者到中级水平的研究人员和实验室专业人员，他们希望处理和分析与组织切片、血细胞、藻类及其他生物样本相关的图像。

通过本次培训，参与者将能够：

• 熟悉 Fiji 界面并使用 ImageJ 的核心功能。
• 预处理和增强科学图像以更好地进行分析。
• 定量分析图像，包括细胞计数和面积测量。
• 使用宏和插件自动化重复任务。
• 根据生物学研究中的特定图像分析需求定制工作流程。

课程形式

• 互动式讲座和讨论。
• 大量练习和实践。
• 在实时实验室环境中进行实际操作。

课程定制选项

• 如需为本课程定制培训，请联系我们安排。

Fiji 和 ImageJ 简介

• Fiji 的概述及其在科学研究中的应用
• 了解 ImageJ 的架构与插件
• 安装与配置 Fiji 以获得最佳性能

基本图像处理技术

• 图像采集与导入格式
• 调整对比度、亮度及应用滤镜
• 图像堆叠与投影方法

高级 Image Analysis

• 分割技术：阈值与边缘检测
• 组织样本中的物体计数与颗粒分析
• 测量面积、周长及其他形态特征

处理 Bio 样本

• 处理组织、血细胞与藻类的图像
• 染色组织的颜色分解与分析
• 延时分析与细胞运动追踪

自动化与自定义

• 创建并运行宏以处理重复任务
• 使用 Fiji 插件进行专项分析
• 使用 ImageJ 宏语言 (IJM) 进行基本脚本编写

Data Management 与报告

• 导出结果并生成报告
• 图像标注与数据准备以供发表
• 可重复图像分析的最佳实践

总结与下一步